斑点九棘鲈是分布最广的石斑鱼种，它的分布范围是从红海到南非，向东分布到法属玻里尼西亚（位于大洋洲）和皮特凯恩群岛（包括东澳大利亚），南至豪勋爵岛（澳大利亚），北抵日本南部的广大海域。斑点九棘鲈在20世纪50年代的夏威夷群岛，被当做一种竞赛性鱼被人们所知道。

体宽明显小于头长，其体长是其体宽的2.7-3.2倍。其体长是头长的2.4-2.7倍；眼小，眼睛的直径明显小于眼下缘到其吻上部的距离；眶间骨区平坦微凸；前鳃盖骨圆形，幼鱼前鳃盖骨边有细微锯齿，成鱼几乎十分平滑；下鳃盖和鳃盖间骨平滑；上颌有鳞，鳞片一直延展过眼。上肢鳃耙9-11根，下肢鳃耙17-19根，下肢退化鳃耙很难与间生式骨板区分开来。背鳍有9根鳍棘、15-17根鳍条，鳍棘之间间相有膜；臀鳍有3根鳍棘、9根鳍条；胸鳍有16-18根鳍条；胸鳍明显比腹鳍长，头长是胸鳍长的1.4-2.0倍；腹鳍没有延伸至肛门，且头长是腹鳍长的1.9-2.4倍；尾鳍圆形。侧体有栉磷，成鱼还有一些辅鳞；侧线鳞46-51；侧线鳞系95-110.

活鱼体色：
整体深棕色，体覆黑圈蓝色眼孔小斑；在身体后方通常有5到6条暗条纹，胸前有一大片暗区；奇鳍后缘通常有一白色细线纹；奇鳍末端有时呈红褐色；背鳍鳍棘顶点的三角膜为金橘色。

标本体色：
整体深棕色，蓝色眼孔斑很明显。白色条纹一般消失，但是可能会在身体后部留有一些模糊暗淡的区域。

50 cm TL

斑点九棘鲈整体深棕色，体覆黑圈蓝色眼孔小斑；在身体后方通常有5到6条暗条纹，胸前有一大片暗区；奇鳍后缘通常有一白色细线纹；奇鳍末端有时呈红褐色；背鳍鳍棘顶点的三角膜为金橘色。

【线粒体全基因组序列】
GCTATTGTAGCTTAAATTTAAAGCATAACACTGAAGATGTTAAGATGGGCCCTAATAAAGCCTCGAAAGC
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CATTCCTAACATCCCTGATAAACTCCGAAAAACAAGAAAAAGCCTCGAGTATCTAAATAAGCCTCAGCTA
AAAAATTCATCGATTGTACCGATACAATACTTAAACT

ceargA
ceargB
cearg01：台湾垦丁
cearg02：海南西沙
cearg03：海南

[线粒体COI序列]
CTCTATTTAGTCTTTGGTGCCTGAGCCGGTATAGTAGGGACAGCACTCAGCCTATTAATTCGAGCTGAATTAAGCCAGCCAGGTGCTCTTCTGGGCGATGATCAGATTTATAATGTTATTGTCACGGCACACGCTTTCGTAATAATCTTCTTCATAGTAATGCCAATTATGATTGGCGGTTTCGGAAACTGACTTATCCCCCTAATAATTGGTGCTCCTGACATAGCATTCCCCCGAATAAATAACATGAGCTTCTGACTTCTTCCCCCATCTTTCCTACTTCTGCTGGCCTCCTCTGGAGTAGAAGCAGGTGCTGGAACTGGCTGAACAGTTTACCCCCCTCTAGCTGGCAACTTAGCCCATGCAGGCGCATCTGTTGACCTAACCATCTTCTCCCTGCATTTAGCAGGTATTTCATCAATCCTAGGGGCGATTAATTTTATCACAACCATTATTAACATGAAACCTCCAGCTATTTCCCAATATCAAACGCCCCTGTTTGTATGAGCTGTTCTAATTACAGCTGTTCTTCTTCTCCTCTCTCTTCCTGTCCTTGCTGCCGGCATTACAATACTTCTAACAGATCGAAATCTAAACACCACCTTCTTTGACCCAGCTGGCGGAGGAGACCCAATTCTTTATCAGCACTTATTC